年の瀬に今年一年を振り返っておこう。・趣味とにかくポケモンにハマった一年だった。完全にポケモンGOの影響。 ポケモンスタンプラリーも行ったしサンムーンも買ったしポケモンカードも嗜んだ。 生まれて初めてミュウツーの逆襲を見て、引くくらい泣いた。…

多くの人々はじめまして。@Yohei__Kです。駄ブログへようこそ。 現在博士後期課程で海洋微生物の研究をしつつ、生命情報若手の会のスタッフをやったり、ポケモン(サン)をやったり、ポケモン(GO)をやったりしています。MTGとボードゲームと音楽関係は最近全然…

最近やたら論文にかっちょいい系統樹載ってるなぁと思うと大体iTolで書かれてることが多いと思うのですが、あんまりわかりやすい解説がないので試行錯誤の内容をメモっていく。目標はこんなやつ書くこと ・登録が必要 ・挙動はブラウザに依存するっぽい(僕の…

setwd ("hogehoge") #入力は以下のような感じ #A+ 0.2 0.5 0.2 0.7 0.9 #A- 0.5 0.6 0.1 0.5 0.6 1.2 3.0 0.8 #B+ 0.2 0.5 0.2 0.7 0.9 #B- 0.5 0.6 0.1 0.5 0.6 1.2 3.0 0.8 dat1<-read.delim("hugahuga.tsv", sep="\t", stringsAsFactors=FALSE, header=FA…

タイトルの通り。 MegaよりもSeaViewよりも軽いし落ちない。 #!/usr/bin/env python #coding: UTF-8 #よく使うモジュールは何も考えずに書く import sys import re import os import glob import copy import commands from bisect import bisect from Bio i…

ある遺伝子ホモログについて、代表配列20個程度がある状態がスタート。 この配列をnt、env_ntデータベースに投げてヒットした領域をmulti fastaとして取り出したい。そんなのしょっちゅうやってるよと思ったが意外とめんどくさかった。 なんでかというとファ…

統計の問題集をちまちま解いているのですが共分散の所でちょっと詰まった。 問題としては独立な二つの正規分布(norm1, norm2)があり、それらの分散は何れも１。 このとき、norm1と(norm1+norm2)/√2の共分散を求めよ、という感じ。 回答みても直感的に理解で…