mafftのオプション
Bioinformatics for DNA Sequence Analysis - Springer
この資料に、mafftのオプションを決める際の指針が記述してあった。
例えば、MSAに多くのinternalなギャップが入ることが予想される場合は-einsi オプション、terminalな領域にのみギャップが入ることが予想される場合は-linsiオプションを用いる、など。
Bioinformatics for DNA Sequence Analysis - Springer
この資料に、mafftのオプションを決める際の指針が記述してあった。
例えば、MSAに多くのinternalなギャップが入ることが予想される場合は-einsi オプション、terminalな領域にのみギャップが入ることが予想される場合は-linsiオプションを用いる、など。