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ピエール瀧になりたい

備忘録として

mafftのオプション

Bioinformatics for DNA Sequence Analysis - Springer

この資料に、mafftのオプションを決める際の指針が記述してあった。

例えば、MSAに多くのinternalなギャップが入ることが予想される場合は-einsi オプション、terminalな領域にのみギャップが入ることが予想される場合は-linsiオプションを用いる、など。